Predykcja i generacja antybiotyków przeciw przyszłym patogenom za pomocą ApexOracle
Narastający kryzys oporności na antybiotyki (AMR) wymaga nowych rozwiązań obliczeniowych, które wyprzedzą szybko ewoluujące patogeny. ApexOracle to zintegrowana platforma ML, służąca zarówno do przewidywania aktywności związków wobec określonych szczepów bakteryjnych, jak i do generacji de novo cząsteczek celowanych na przyszłe „superbakterie”. Motywacja i zakres Globalne znaczenie: AMR odpowiada za blisko 5 mln zgonów rocznie. Tradycyjne wyzwania: Długotrwałe i kosztowne procesy odkrywania leków, reagujące na bieżące zagrożenia. Cel ApexOracle: Połączenie kontekstu genomowego z projektowaniem molekularnym w jednym przepływie. Architektura ApexOracle Wyobraź sobie, że masz trzy zestawy wskazówek: kod genetyczny bakterii (genom), krótki opis jej właściwości (jak prosta karta informacyjna) oraz składniki potencjalnego leku (przepis chemiczny). ApexOracle działa jak wysoce zaawansowany detektyw, który jednocześnie analizuje wszystkie trzy źródła informacji. Następnie dobiera najskuteczniejsze molekuły, a nawet tworzy całkowicie nowe przepisy chemiczne, które mogą zatrzymać rozwój bakterii. ...